工程機器代理進口報關公司流程分析如下：

　　1. 準備資料：首先需要準備好進口工程機器的相關資料，包括合同、發票、裝箱單、運輸單據等。

　　2. 檢驗檢疫：進口工程機器需要進行檢驗檢疫，包括檢驗設備是否符合國家標準、是否存在安全隱患等。

　　3. 申報報關：將準備好的資料提交給報關代理公司，由代理公司進行申報報關。

　　4. 繳納稅款：根據進口工程機器的稅率，繳納相應的稅款。

　　5. 收取貨物：報關代理公司完成報關手續后，可以前往海關指定的地點收取貨物。

　　6. 交付客戶：將貨物交付給客戶，并提供相關的報關單據和發票等。