上海化妝品報關公司操作流程及手續如下：

　　1. 準備報關材料：包括進口合同、發票、裝箱單、提單等。

　　2. 申報報關：將準備好的報關材料提交給報關代理公司，代理公司會根據海關規定填寫報關單并進行申報。

　　3. 海關查驗：海關會對進口的化妝品進行查驗，包括外觀、包裝、標簽、成分等方面。

　　4. 繳納稅款：根據海關規定，進口化妝品需要繳納相關稅款。

　　5. 放行取貨：經過海關查驗并繳納稅款后，化妝品可以正常放行取貨。

　　需要注意的是，化妝品進口報關需要遵守相關法律法規和海關規定，如標簽標識、成分檢測等方面的要求。建議選擇專業的報關代理公司進行委托報關，以確保報關手續的順利進行。